Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VPS37CA5D8V6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms