Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPDC1A2A3K4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPDC1A2A3K4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms