Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SLFN12L-201ENST00000260908 3119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 LINC01095-202ENST00000507726 1715 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
MKRN3Q13064 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms