Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 EEF1A1P24-201ENST00000451469 1378 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PDE4DQ08499 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms