Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL050403.2-202ENST00000603462 492 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 OR11G2-202ENST00000641682 3786 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CTD-2201I18.1-202ENST00000514042 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SNORA51.7-201ENST00000384171 134 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LINC01805-201ENST00000436433 572 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
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MKRN4PQ13434 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
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MKRN4PQ13434 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
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MKRN4PQ13434 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
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MKRN4PQ13434 CDH18-207ENST00000507958 3542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
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MKRN4PQ13434 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
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MKRN4PQ13434 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
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MKRN4PQ13434 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC022730.2-201ENST00000465359 452 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
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