Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms