Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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NFIXQ14938 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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NFIXQ14938 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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NFIXQ14938 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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NFIXQ14938 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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NFIXQ14938 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
NFIXQ14938 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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