Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00312Q9Y6C7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00312Q9Y6C7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms