Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LEMD3Q9Y2U8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LEMD3Q9Y2U8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms