Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF3AQ9Y2N7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF3AQ9Y2N7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF3AQ9Y2N7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF3AQ9Y2N7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF3AQ9Y2N7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF3AQ9Y2N7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms