Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KDM2AQ9Y2K7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KDM2AQ9Y2K7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms