Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC4Q9Y296 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms