Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NUDCQ9Y266 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms