Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SHOC2Q9UQ13 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SHOC2Q9UQ13 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms