Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SHANK2Q9UPX8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHANK2Q9UPX8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms