Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
L1RE1Q9UN81 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L1RE1Q9UN81 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms