Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNRGQ9UMZ2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNRGQ9UMZ2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms