Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNPO2Q9UMS6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNPO2Q9UMS6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms