Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PNMA8BQ9ULN7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PNMA8BQ9ULN7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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