Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BRPF3Q9ULD4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BRPF3Q9ULD4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms