Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PNMA3Q9UL41 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PNMA3Q9UL41 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms