Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RCAN3Q9UKA8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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