Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXL4Q9UKA2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FBXL4Q9UKA2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms