Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GDF2Q9UK05 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms