Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GGA1Q9UJY5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GGA1Q9UJY5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms