Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GGA2Q9UJY4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GGA2Q9UJY4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms