Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSKSQ9UJT2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSKSQ9UJT2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms