Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TNFRSF10DQ9UBN6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TNFRSF10DQ9UBN6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms