Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms