Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms