Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KLHL42Q9P2K6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms