Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GDE1Q9NZC3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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