Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMOD3Q9NYL9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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