Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms