Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARHGEF38Q9NXL2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms