Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C1orf109Q9NX04 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms