Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
GINM1Q9NU53 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GINM1Q9NU53 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms