Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4L1Q9NU39 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms