Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms