Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM7SF3Q9NS93 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM7SF3Q9NS93 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms