Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH2B1Q9NRF2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms