Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPHNQ9NQX3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms