Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRDM7Q9NQW5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms