Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVK-5Q9HDB9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ERVK-5Q9HDB9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms