Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VAT1LQ9HCJ6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms