Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC52A2Q9HAB3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms