Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPAP3Q9H6T3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPAP3Q9H6T3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms