Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NBPF3Q9H094 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBPF3Q9H094 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms