Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT23Q9C075 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT23Q9C075 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms