Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RSPO3Q9BXY4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RSPO3Q9BXY4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms